Descasque e corte as cebolas ao meio, fatie finamente. Leve ao fogo uma panela com fundo grosso, depois de quente adicione a manteiga e a cebola e refogue muito bem, até elas começarem a ficar coradas.
Acrescente a calabresa e refogue mais um pouco, coloque a colher de farinha de trigo e refogue ligeiramente, adicione o vinho, o caldo e o tomilho.
Misture bem e cozinhe por uns 15 minutos com a panela semitampada.
Assim que a sopa estiver mais espessa, ajuste o sal, adicione noz-moscada ralada na hora. Desligue o fogo, coloque a sopa em cumbucas individuais, acomode fatias de pão sobre a sopa, cubra com queijo e leve ao forno para gratinar por aproximadamente 15 minutos.
Caso seu fogão tenha grill você pode utilizar nos últimos minutos.